48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0060 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0060  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0044  tRNA-His  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t38  tRNA-His  87.32 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0045  tRNA-His  88.52 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000161818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0017  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000497759  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0046  tRNA-His  92.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216845  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0032  tRNA-His  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0040  tRNA-His  83.78 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  86.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  86.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  86.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0088  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000578887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0023  tRNA-His  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00261193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  86.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  86.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09670  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.253938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0022  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t53  tRNA-His  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266756  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t51  tRNA-His  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297022  normal  0.0342999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0056  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441531  hitchhiker  0.000421816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0058  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606593  hitchhiker  0.000424792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0064  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540821  normal  0.0431987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0066  tRNA-His  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308433  normal  0.0175019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  82.67 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0043  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.130453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0041  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.137953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0019  tRNA-His  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0563192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0018  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00677914  normal  0.417435 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000153982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0020  tRNA-His  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.889352  normal  0.733975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000169837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1392  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>