110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0043 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08830  tRNA-His  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406412  normal  0.0611739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0047  tRNA-His  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.627276  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0024  tRNA-His  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28660  tRNA-His  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0457487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0038  tRNA-His  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0016  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0023  tRNA-His  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0032  tRNA-His  88 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.30442  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0623  tRNA-His  87.84 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0104886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0042  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0030  tRNA-His  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.142316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24880  tRNA-His  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0015  tRNA-His  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14029  tRNA-His  86.11 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0014  tRNA-His  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  86.57 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  90 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0044  tRNA-His  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0022  tRNA-His  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0045  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.447472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0082  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0039  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.639716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0040  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.646222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0042  tRNA-His  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.187364  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0015  tRNA-His  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000558308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0087  tRNA-His  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0036  tRNA-His  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0723333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0018  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.898186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0022  tRNA-His  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0060  tRNA-His  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0015  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0038  tRNA-His  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0186  tRNA-His  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0036  tRNA-His  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0128871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0046  tRNA-His  86.27 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216845  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0033  tRNA-His  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.704433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0095  tRNA-His  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0119  tRNA-His  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0557096  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0037  tRNA-His  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0609753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0033  tRNA-His  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0028  tRNA-His  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0683  tRNA-His  84.13 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.684611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0050  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0788  tRNA-His  84.13 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0011  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0021  tRNA-His  86.44 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0032  tRNA-His  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0041  tRNA-His  84.51 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-His-1  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00107575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4318  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0047  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0462581  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0045  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0302111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0776  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.522118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0057  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0005  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0007  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0023  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0035  tRNA-Pro  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000987265  normal  0.0118441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0034  tRNA-Pro  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129809  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0028  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000264916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0045  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000126264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0040  tRNA-His  82.43 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0013  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0036  tRNA-His  86.21 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000713799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>