More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_R0013 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0015  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0358184  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0044  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0563  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3906  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0009  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0632533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0017  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0175356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0024  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0082  tRNA-Ala  94.2 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000141223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03719  tRNA-Ala  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03615  tRNA-Ala  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00201  tRNA-Ala  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0030  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.915184  normal  0.110132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00328  tRNA-Ala  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0034  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000978021  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00195  tRNA-Ala  98.21 
 
 		 73 bp  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0014  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0057  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0018  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0008  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00058082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t10  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.922263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0026  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0540884  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0062  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000746222  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5655  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000213498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5696  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5724  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000745652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t62  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.132362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000729752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000677485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000396068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00147071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000936426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0019  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0023  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 79 bp  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0033  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000292455  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0003  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0091  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000036342  hitchhiker  0.00439232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0010  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0102  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0041  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0131  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000907835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>