More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_R0008 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_R0008  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00058082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0057  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0044  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0563  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3906  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0009  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0632533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0017  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0175356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0024  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0082  tRNA-Ala  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000141223  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00201  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00328  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03719  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03615  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00195  tRNA-Ala  97.26 
 
 		 73 bp  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0097  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.636111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0159  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0561625  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0148  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00584205  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0133528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0060  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000375554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0047  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000145993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0627  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351596  normal  0.0173581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0116  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000551315  hitchhiker  0.000206689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0011  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000768002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0083  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00420307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0113  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000340482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0080  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00215161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4205  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0066  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000458923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0052  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00660859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4292  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000724507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4264  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000257856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0084  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0403496  normal  0.138563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0009  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0174  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0037  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0515316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0103  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000241452  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0009  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0330321  hitchhiker  0.00801031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0092  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.892072  normal  0.128947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0026  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0505593  unclonable  0.00000400099 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0469  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000319828  normal  0.0257822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0004  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000571046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0128  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000050642  normal  0.0403899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0036  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000477203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0043  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0457533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0051  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000604865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0071  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0010  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0312257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0003  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0369112  normal  0.119668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0136  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00216057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0044  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000111435  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna032  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00431458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna040  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00772194  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna080  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0703705  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna156  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0009  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.306257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0073  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0694926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0009  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.441626  hitchhiker  0.00992497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0022  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000187329  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0073  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0105913  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0008  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000976028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0021  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0879619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0017  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161415  hitchhiker  0.00407434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0012  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133641  hitchhiker  0.000473278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0156  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223913  hitchhiker  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0071  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000469836  normal  0.108632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0134  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000329737  normal  0.0145655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t053  tRNA-Ala  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0138736  hitchhiker  0.000000229903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t051  tRNA-Ala  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0611091  hitchhiker  0.0000203844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t008  tRNA-Ala  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.109166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00468  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06829  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3112t  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3076t  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00255258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3088t  tRNA-Ala  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00060  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0512928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00072  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0076  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000601074  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0101  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00826965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0008  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000639755  hitchhiker  0.000460021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0102  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0110992  decreased coverage  0.00334297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4642  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000860884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0013  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00682305  normal  0.0131839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5076  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000555714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5093  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000403795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4703  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0095  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0006  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00464814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0063  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00661902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0126  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000381785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>