31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0012 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0036  tRNA-Asn  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0622774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0009  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.940514  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0035  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 106 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0007  tRNA-Asn  94.59 
 
 		 106 bp  58  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0001  tRNA-Ile  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0001  tRNA-Ile  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000056497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0011  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.580851  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0776  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.522118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0487  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.112524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly02  tRNA-Gly  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0010  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>