32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0002 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0001  tRNA-Asp  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0048  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0033  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 77 bp  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0008  tRNA-Asp  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0023  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000368912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0031  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000438014  normal  0.0251271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0029  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000411278  normal  0.024303 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0021  tRNA-Asp  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0041  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00163216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0021  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.652405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>