299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0048 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0048  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0033  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0002  tRNA-Asp  94.87 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0001  tRNA-Asp  93.59 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  91.03 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  91.03 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0008  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0029  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000411278  normal  0.024303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0031  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000438014  normal  0.0251271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0023  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000368912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0021  tRNA-Asp  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0041  tRNA-Asp  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00163216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0004  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0041  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000931671  normal  0.0847681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0036  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0004  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0037  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.060369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0048  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  85.94 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0044  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2258  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0012215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2261  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000972867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000352228  hitchhiker  0.00000353756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0048  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000361323  normal  0.0154574 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0047  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0027  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0018  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0021  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0024  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0044  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0294288  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0042  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000507757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0030  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0018  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0050  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0018  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0124  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0079  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000855359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0016  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0021  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0325051  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0046  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000017154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000081344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0019  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0571821  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0004  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712007  hitchhiker  0.000000679169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0019  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0100  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000567752  hitchhiker  0.00319693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0108  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0129  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0024  tRNA-Asp  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000320512  normal  0.92756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>