50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0052 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  98.67 
 
 		 78 bp  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0082  tRNA-Asp  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0059  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 78 bp  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0036    88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132649  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0055  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0001  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0051  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>