174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0005 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_895  tRNA-Glu  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000162495  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000114551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna16  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna14  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.875319  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0030  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0034  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187046  normal  0.0177267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0007  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0050  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0040  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000578854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0060  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0008  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  92.11 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0022  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.777286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0022  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0057  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000756674  normal  0.548722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0052  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0034  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00296097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0059  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000917431  normal  0.553022 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0055  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101693  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t31  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05430  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000667739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60540  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27600  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0544848  hitchhiker  0.00250338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60520  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.671804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60120  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0028  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423864  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0030  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.044277  normal  0.615022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0070  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924064  normal  0.541649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0072  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0074  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.562141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0079  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0081  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.863726  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1996  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1998  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2336  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0131684  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0389  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0245226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0041  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0052  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>