291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0034 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  95.74 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  95.45 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0054  tRNA-Asp  92 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  89.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0057  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0671141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0082  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0059  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0052  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07693  tRNA-Gly  95 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0011  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.619648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0016  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0017  tRNA-Asp  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0031  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0288989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000153906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_918  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0035  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0030  tRNA-Glu  91.49 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06170  tRNA-Asp  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.58434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0020  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0054  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0186416  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 98 bp  50.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0046  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14012  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2553699999999997e-37  hitchhiker  0.00000344638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0013  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0037  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0700091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0049  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0030  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0020  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0004  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 97 bp  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0046  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923307  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0051  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0045  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0016  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAspVIMSS1309352  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0875089  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0025  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0016  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  85 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAspVIMSS1309079  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAspVIMSS1309111  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAspVIMSS1309200  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0997712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAspVIMSS1309155  tRNA-Asp  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0722845  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  96.43 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0025  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.627551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>