18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00120 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00420  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04300  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239342  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04380  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04010  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000945479  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00120  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00563215  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19680  tRNA-His  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 
89 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  44.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 
76 bp  44.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  100 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  100 
 
 
76 bp  44.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  100 
 
 
78 bp  44.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  44.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>