22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_R0005 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  92.47 
 
 		 94 bp  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  81.8  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  95.83 
 
 		 95 bp  79.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  83.7 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0029  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00271379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>