140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0036 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  88.89 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0040  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0063  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594649  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0012  tRNA-Asp  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000035701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0068  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0018  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.114799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0080  tRNA-Asp  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0022  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00441825  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0049  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0598225  unclonable  6.706210000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0086  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0155365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0040  tRNA-Asp  85.9 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0028  tRNA-Asp  88.46 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000351463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0051  tRNA-Asp  84.72 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0034  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0178  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1829  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.150198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04530  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000141295  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04532  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000147754  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2262  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0017  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0025  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000547625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0028  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000186167  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0042  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000507757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0043  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193978  normal  0.0518399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0020  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.015357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0046  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0033  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00294009  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0024  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000320512  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0025  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000839406  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0026  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000028925  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0027  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000271545  normal  0.890927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0028  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000281515  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0024  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0027  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0020  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0038  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0044  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0294288  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0064  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0067  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0069  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197557 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1638  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.27117e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0049  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.529463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0042  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0024  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.603118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0026  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.472437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0043  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.555822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0048  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000611669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0023  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.700575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0039  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0012  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>