299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_AR0028 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_R0023  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.700575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04530  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000141295  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_003295  RS04532  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000147754  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.529463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0017  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0025  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000547625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0028  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.00000000000186167  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.555822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0048  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000000611669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0039  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0042  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0040  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291088  normal  0.300021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0043  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193978  normal  0.0518399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0020  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.015357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0046  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0038  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna061  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna092  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00954966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2258  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0012215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2259  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00453346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2260  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00104987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2261  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000972867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2262  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0067  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0024  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.603118 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna036  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna083  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0025  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000839406  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0026  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000028925  normal  0.89976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0045  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115238  normal  0.0333455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0048  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000361323  normal  0.0154574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0063  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748951  normal  0.206184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0032  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.167731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0033  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00294009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0042  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000507757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0027  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0024  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0018  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.130391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0024  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000320512  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna047  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0027  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000271545  normal  0.890927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0505  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00547208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0064  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0069  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0061  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0028  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000281515  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1638  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 79 bp  145  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.27117e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0026  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.472437 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna153  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.908141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0044  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0294288  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3181t  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.162425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3115t  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3140t  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3185t  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 75 bp  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.643371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3209t  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2713  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000225937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0032  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000015276  normal  0.216966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0019  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0571821  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0021  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0325051  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2099  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000679661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02887  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0037  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2482  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2484  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000127815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2351  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538678  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3214  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106519  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2471  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2621  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000284605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2623  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000119328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0019  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0460916  hitchhiker  0.000581212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0046  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000184395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0016  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000350456  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2455  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0030  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2536  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0232654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2538  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00838842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1221  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2324  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0030  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000504867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0094  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000513172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0098  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0101  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3492  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 79 bp  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0030  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372782  normal  0.435881 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0034  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000139644  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0049  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0056  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172836  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0049  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203768  normal  0.0133799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0052  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050358  normal  0.257464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0056  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0012  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0047  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0050  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744732  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0054  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000254404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>