More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0054 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0086  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0155365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0063  tRNA-Asp  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594649  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0012  tRNA-Asp  96.08 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000035701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  94.34 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  94.34 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  89.87 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0068  tRNA-Asp  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0049  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0598225  unclonable  6.706210000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0028  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000351463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  93.1 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0040  tRNA-Asp  92.98 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0129  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1946  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0021  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0325051  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5660  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000269151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5668  tRNA-Asx  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5670  tRNA-Asx  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5719  tRNA-Asx  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735  tRNA-Asx  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0508146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000555037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000136459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.5989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00238664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 79 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000621427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2623  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000119328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2099  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000679661  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000798458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0019  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0571821  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0030  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0056  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0047  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000429092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0047  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0050  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744732  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0054  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000254404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>