More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0063 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0063  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594649  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0049  tRNA-Asp  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0598225  unclonable  6.706210000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0012  tRNA-Asp  95.16 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000035701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0038  tRNA-Asp  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0040  tRNA-Asp  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000865357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0028  tRNA-Asp  91.94 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000351463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0049  tRNA-Asp  92.45 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000144265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  93.75 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0052  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000174221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0041  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00163216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0033  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000000933276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0031  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000203604  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  93.62 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  86.49 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0006  tRNA-Asp  95.24 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0158  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0031  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00218034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0068  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0047  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0040  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0039  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0040  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0021  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1221  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000248488  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02887  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0030  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000504867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0015  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.103897  normal  0.235833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0094  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000513172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0098  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0101  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0021  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3358  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>