230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0086 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_R0086  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0155365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0068  tRNA-Asp  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0031  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  88.16 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0040  tRNA-Asp  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  89.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0051  tRNA-Asp  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  91.49 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0029  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0102233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  87.69 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0063  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594649  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0028  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926195  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0052  tRNA-Asp  94.59 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0012  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000035701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0049  tRNA-Asp  92.31 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0024  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0173  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0414  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0616515  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0158  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0078  tRNA-OTHER  87.04 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0025  tRNA-Asp  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.140338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3492  tRNA-Asp  88 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  86.15 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2471  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0042  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000403419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1221  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0064  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0066  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0027  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0094  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000513172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0098  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0101  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2536  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0232654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0108  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0129  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0047  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000429092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0019  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0571821  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0021  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0325051  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1946  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2099  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000679661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3214  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3358  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0032  tRNA-Asp  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0139  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.595909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2482  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2484  tRNA-Asp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000127815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>