299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2623 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3358  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2536  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0232654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3214  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2806  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2351  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1372  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02887  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1946  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0052  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050358  normal  0.257464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0023  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.407669  normal  0.337177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0030  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372782  normal  0.435881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0056  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176781  normal  0.237793 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2484  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000127815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203768  normal  0.0133799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2471  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2621  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000284605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2623  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000119328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0032  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000015276  normal  0.216966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000350456  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2099  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000679661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2713  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000225937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0046  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000184395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3492  tRNA-Asp  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0056  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172836  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000139644  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2482  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2538  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00838842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000139043  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0030  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000504867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0094  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000513172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1221  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0098  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0101  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0460916  hitchhiker  0.000581212 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2324  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0056  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0247  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2455  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000254404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0057  tRNA-Asp  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30339  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0060  tRNA-Asp  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000184808  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0064  tRNA-Asp  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000566491  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41200  tRNA-Asp  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259841  normal  0.399457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0108  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00436109  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0004  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.660889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0050  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0046  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000017154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0159  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00117614  hitchhiker  0.0000000316845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0060  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580753  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0050  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t001  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t053  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t054  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0125  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000018032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0127  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000164688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0126  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000166381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0021  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.76663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0004  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0080  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000081344  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0119  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0531426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0012  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0079  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000855359  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0041  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0126  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0153  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000144373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0012  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0005  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.128453  unclonable  0.0000112956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0128  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000146033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0177  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0047  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0018  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0066  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000109987  hitchhiker  0.00000103719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>