299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0034 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0178  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1829  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.150198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  94 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  90 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0651  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0050  tRNA-Asp  91.84 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000248488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0091  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0013  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1924  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0278323  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0062  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.352281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0026  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.935679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  60  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0093  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0063  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0470836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0032  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0473  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000478831  normal  0.0378852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0040  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.824145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0033  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0040  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.725939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4197  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4219  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000946813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0039  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0100  tRNA-Asp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0485231  normal  0.35934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0058  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0146  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000101339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0047  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5652  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000163084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5676  tRNA-Asx  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000169652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5700  tRNA-Asx  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000330168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5719  tRNA-Asx  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735  tRNA-Asx  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0508146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0060  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.285107  normal  0.0443211 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00173091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000294938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.5989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000621427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0355415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000325882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000639315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0043  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.956354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0110  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000668048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0083  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000718612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000451137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000798458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0108566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0150  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0130  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0034  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0295  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0866  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5021  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00200372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0031  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5668  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0126  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00683809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA43  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0015  tRNA-Asp  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>