51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1217 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1829  tRNA-Asp  90 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.150198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0178  tRNA-Asp  90 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0628271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0034  tRNA-Asp  90 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0088  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0045  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0038  tRNA-Asp  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0747  tRNA-Asp  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt018  tRNA-Asp  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00304559  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R14  tRNA-Asx  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1606  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.847365 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1597  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287009  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1571  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0013  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00001857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0006  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.217268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0568  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 155 bp  44.1  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0036  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0016  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.330685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>