34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R14 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_R14  tRNA-Asx  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  94.29 
 
 
75 bp  54  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  90.7 
 
 
73 bp  54  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0050  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.989486  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0047  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0035  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0035  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000429398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0047  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0050  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  89.13 
 
 
76 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0004  tRNA-Asp  91.67 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0002  tRNA-Asp  91.67 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0002  tRNA-Asp  91.67 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0187578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0414  tRNA-Asp  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0616515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0173  tRNA-Asp  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0024  tRNA-Asp  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00556712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0102233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  88.64 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  88.37 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0038  tRNA-Asp  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298827  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0009  tRNA-Asp  87.23 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.897557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  89.47 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0018  tRNA-Asp  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.114799  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0022  tRNA-Asp  91.18 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00441825  normal  0.138738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>