13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1571 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1571  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1606  tRNA-Asp  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.847365 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1597  tRNA-Asp  97.26 
 
 		 73 bp  129  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287009  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt018  tRNA-Asp  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0747  tRNA-Asp  97.06 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0016  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.330685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0024  tRNA-Asp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0173  tRNA-Asp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0414  tRNA-Asp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0616515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000114551  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_895  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000162495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>