32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0016 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.330685  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1400  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.754313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0056  tRNA-Asp  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0054  tRNA-Asp  95 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000015644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1571  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1597  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287009  normal  0.565179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1606  tRNA-Asp  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.847365 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1179  tRNA-Asp  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.015483  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0012  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25090  tRNA-Asp  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.657176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0009  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.250307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0067  tRNA-Glu  91.11 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000153878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_895  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.068843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0014  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0033  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000114551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1217  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.795729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>