More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18600 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  96.36 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0052  tRNA-Glu  91.18 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  94.55 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0065  tRNA-Glu  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0037  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1357  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0018  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0009  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.250307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0067  tRNA-Glu  92.16 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000153878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08670  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  97.44 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0023  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0064  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0040  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4223  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4465  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000990931  hitchhiker  0.00000000000884096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3699  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0040697  normal  0.0437365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0079  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0250396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0389  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0245226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4512  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00641389  normal  0.576073 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0037  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000713649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0060  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0296657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5478  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00757172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4102  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4173  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00665107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2874  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.403763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2987  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0021  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5193  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5433  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000105127  normal  0.0151681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4510  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0115463  normal  0.0174598 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0099  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000015218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0021  tRNA-Glu  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00556974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>