75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0007 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0007  tRNA-Glu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05430  tRNA-Glu  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000667739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0047  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00511598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0023  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000272439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0012  tRNA-Glu  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  91.53 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08980  tRNA-Glu  87.1 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  86.49 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0050  tRNA-Glu  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.199689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0018  tRNA-Glu  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0005  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0021  tRNA-Glu  85.14 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0011  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000477421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0044  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.424597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0009  tRNA-Glu  94.59 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0057  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0003  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0763147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0042  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0044  tRNA-Glu  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000878437  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0016  tRNA-Asp  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.330685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  86.44 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0003  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.541849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0059  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778422  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.624035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0063  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.453793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0058  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0003  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0008  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.137001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0061  tRNA-Asp  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213115  normal  0.210612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0020  tRNA-Glu  92.11 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00671129  hitchhiker  0.00000169389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>