247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0568 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0568  tRNA-Phe  100 
 
 		 155 bp  307  5.0000000000000004e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  95.16 
 
 		 73 bp  99.6  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0044  tRNA-Phe  96.49 
 
 		 76 bp  97.6  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000279545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 73 bp  87.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0064  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0324982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0066  tRNA-Phe  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.572746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0051  tRNA-Phe  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0044  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0075  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0053  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000574289  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0073  tRNA-Phe  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0078  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00739535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0027  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.293846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0111  tRNA-Phe  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0238914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0039  tRNA-Phe  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R13  tRNA-Phe  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0057  tRNA-Asp  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0043  tRNA-Asp  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0112  tRNA-Asp  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00279074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0074  tRNA-Asp  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0005  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0016  tRNA-Phe  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07689  tRNA-Phe  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.754049  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2143  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.837843  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0289  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0057  tRNA-Asp  87.5 
 
 		 73 bp  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0442  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2270  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.105735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1357  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.503492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1750  tRNA-Phe  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5679  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0148984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5048  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5806  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0530  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.95974e-30 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0077  tRNA-Asp  86.57 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00173091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000555037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000136459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.5989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00238664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0605  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000119213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0307  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0295  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000621427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0355415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-5  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000325882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-6  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000639315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5036  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4772  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000243469  hitchhiker  6.32528e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0225  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000284447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0283  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0045  tRNA-Asp  86.57 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000116789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5668  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0022  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0866  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4565  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0856586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5738  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000152402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5711  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000863381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tPhe01  tRNA-Phe  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0791  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.86781e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0273  tRNA-Asp  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5660  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000269151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5676  tRNA-Asx  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000169652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5700  tRNA-Asx  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000330168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5719  tRNA-Asx  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000294938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5574  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9393e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4990  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5652  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000163084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 79 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5344  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000194135  hitchhiker  0.00000000000721362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0110  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000668048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0058  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0022  tRNA-Phe  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0046  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0047  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0126  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00683809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5831  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 78 bp  60  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0076889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0106  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00926761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0079  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000702096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0058  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0146  tRNA-Asp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000101339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>