299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tAsp01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tAsp01  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0846987  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp01  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 80 bp  109  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp03  tRNA-Asp  93.33 
 
 		 80 bp  109  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0003  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0651  tRNA-Asp  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0054  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  0.0552316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0052  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0046  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445856  hitchhiker  0.00000000718315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0048  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042005  normal  0.0861498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0050  tRNA-Asp  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.0538679 
 
 
-
 
NC_002950  PGt33  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.205287 
 
 
-
 
NC_002950  PGt43  tRNA-Asp  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.022546 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0052  tRNA-Asp  94.2 
 
 		 78 bp  97.6  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000156743  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAsp02  tRNA-Asp  95.08 
 
 		 80 bp  97.6  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0021  tRNA-Asp  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0024  tRNA-Asp  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000583743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0026  tRNA-Asp  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000484492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0309  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00580589  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0028  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0292  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  0.882483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0029  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0295  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0406525  normal  0.534854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4286  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.706333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0277  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0046  tRNA-Asp  96.23 
 
 		 78 bp  89.7  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000106741  normal  0.144267 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0036  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0040  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00699414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna39  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna40  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4121  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0016  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.034253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0017  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000152694  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0046  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0290  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0426135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0028  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0027  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0026  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0397308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0279  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.703656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0028  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4178  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0303  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0284  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.83496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0298  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4106  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4227  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0047  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.488675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t07  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.802625  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0051  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.681144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0041  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0134468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0027  tRNA-Asp  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556629  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0026  tRNA-Asp  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0364321  normal  0.064648 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0019  tRNA-Asp  90.67 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.4765400000000006e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0025  tRNA-Asp  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0357766  normal  0.112448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0027  tRNA-Asp  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221595  normal  0.0673851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0012  tRNA-Asp  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00003  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.073161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00004  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00065  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0072  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.919613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0073  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0109  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0040  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5197  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0882882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0218  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.112301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0013  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4219  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000946813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5008  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0329155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0100  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0485231  normal  0.35934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0288  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.977337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0228  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4324  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.647358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0039  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4708  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.806032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5085  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.453014  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0200  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0030  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0040  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.824145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0086  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0220  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0230  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0126  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0559205  normal  0.0859752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0085  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0099  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4197  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364203  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0051  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613833  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0025  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0290094  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0040  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.725939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5009  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.730006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0599  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0603  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4644  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00029583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4643  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00729353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1924  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0278323  normal  0.559384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0473  tRNA-Asp  91.8 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000478831  normal  0.0378852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>