22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0048 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  92.21 
 
 		 95 bp  97.6  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  81.8  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0005  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna105  tRNA-Ser  88 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000135439  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna107  tRNA-Ser  88 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000883231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03508  tRNA-Ser  88 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03505  tRNA-Ser  88 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3130t  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3128t  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>