43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0006 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  92.59 
 
 		 91 bp  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  92.59 
 
 		 89 bp  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  91.36 
 
 		 91 bp  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  90.12 
 
 		 92 bp  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  96.49 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  90.12 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  97.92 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  94.34 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  81.8  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0054  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0056  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805943  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0005  tRNA-Ser  97.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 95 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 94 bp  69.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0048  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 94 bp  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01840  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>