17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0058 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  93.26 
 
 		 92 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0005  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  92.13 
 
 		 92 bp  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  91.01 
 
 		 89 bp  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 93 bp  83.8  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0056  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805943  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0054  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0048  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>