15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_R0054 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805943  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 90 bp  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 93 bp  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 92 bp  95.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 89 bp  95.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0005  tRNA-Ser  97.67 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  97.62 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  87.84 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>