19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  95.6 
 
 		 92 bp  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  93.41 
 
 		 91 bp  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  93.41 
 
 		 91 bp  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  92.39 
 
 		 91 bp  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0056  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805943  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0054  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 90 bp  93.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0005  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 89 bp  83.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  94.34 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  95.83 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  83.7 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0029  tRNA-Ser  87.27 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0048  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>