17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0050 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327924  normal  0.0500062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0012  tRNA-Ser  97.8 
 
 		 91 bp  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0004  tRNA-Ser  93.41 
 
 		 90 bp  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0005  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 91 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0005  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  92.59 
 
 		 91 bp  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01890  tRNA-Ser  92.39 
 
 		 93 bp  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.961125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0008  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 89 bp  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0054  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0056  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805943  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0062  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 92 bp  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0005  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 90 bp  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0006  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 92 bp  95.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0058  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 89 bp  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 94 bp  60  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0048  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>