57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0059 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 88 bp  93.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0075  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0065  tRNA-Ser  89.77 
 
 		 86 bp  79.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.773691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0009  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0009  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  87.36 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0088  tRNA-Ser  91.53 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  88.57 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0034  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02690  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0052  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25970  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0827616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1568  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0011  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.213585  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28870  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0008  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0008  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0009  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0010  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.677549  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1402  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0009  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.45522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0471  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0010  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0532  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.936136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.0269773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>