39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_R0011 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.213585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  92.94 
 
 		 88 bp  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0008  tRNA-Ser  92.94 
 
 		 88 bp  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0065  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 86 bp  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.773691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0088  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 89 bp  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0075  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 88 bp  97.6  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  91.78 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 88 bp  97.6  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  97.6  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  89.41 
 
 		 85 bp  97.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 89 bp  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0009  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 86 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503093  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0052  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0059  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 86 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0162637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0053  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0054  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 86 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0055  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 86 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0827616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0008  tRNA-Ser  95.92 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04660  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.321239  normal  0.959578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0009  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0009  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0034  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1402  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02690  tRNA-Ser  84.88 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28870  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  88 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0009  tRNA-Ser  87.76 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0088  tRNA-Ser  87.76 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.632299  hitchhiker  0.00150076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0010  tRNA-Ser  87.76 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.677549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.503711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>