45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28870 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28870  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132157  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02690  tRNA-Ser  94.19 
 
 		 86 bp  123  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599018  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25970  tRNA-Ser  92.05 
 
 		 88 bp  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0009  tRNA-Ser  91.95 
 
 		 88 bp  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0010  tRNA-Ser  91.76 
 
 		 85 bp  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.677549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 88 bp  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  89.77 
 
 		 88 bp  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0009  tRNA-Ser  89.77 
 
 		 88 bp  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 88 bp  93.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0053  tRNA-Ser  88.76 
 
 		 89 bp  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0052  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 85 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14041  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 89 bp  87.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.197809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 89 bp  87.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0059  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0162637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0009  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503093  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0054  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0055  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 86 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0827616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0009  tRNA-Ser  87.06 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.528641  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0008  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0008  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0008  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0075  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0009  tRNA-Ser  90 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0009  tRNA-Ser  90 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04660  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.321239  normal  0.959578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0011  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.213585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0088  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0065  tRNA-Ser  83.72 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.773691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1568  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>