35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_R0089 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  94.38 
 
 		 90 bp  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  94.38 
 
 		 90 bp  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 85 bp  93.7  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  93.65 
 
 		 90 bp  93.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  89.04 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  85.92 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0061  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0007  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0054  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  90.74 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0072  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  85.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0059  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.826409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0053  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451369  hitchhiker  0.000135525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0075  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0009  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0007  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.194729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0010  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.314795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>