76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0005 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  98.85 
 
 		 87 bp  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  96.63 
 
 		 90 bp  153  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0008  tRNA-Ser  95.4 
 
 		 87 bp  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  93.26 
 
 		 90 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  91.76 
 
 		 90 bp  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  92.77 
 
 		 85 bp  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  91.86 
 
 		 88 bp  99.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  93.42 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  86.52 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  86.52 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  87.3 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  87.3 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03510  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.608877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2323  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0026  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  84.21 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  84.06 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  85 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  85 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA35  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189455  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R29  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0064  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000000759704  normal  0.0478316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t28  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t084  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0606382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0057  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.861934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t038  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0086  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0257958  normal  0.0951833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0086  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0207844  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0083  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0290175  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>