55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0004 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 90 bp  123  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  90.8 
 
 		 85 bp  93.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  89.89 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  86.52 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  85.53 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  85.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0008  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0026  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0073  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0064  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000000759704  normal  0.0478316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t084  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0606382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118719  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>