297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_R0034 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 91 bp  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 91 bp  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  91.21 
 
 		 88 bp  113  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  90.11 
 
 		 91 bp  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  90.22 
 
 		 92 bp  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  90.22 
 
 		 92 bp  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  90.22 
 
 		 92 bp  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0023  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.137885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0001  tRNA-Ser  89.01 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 91 bp  93.7  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0073  tRNA-Ser  88.04 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  88.04 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  94.92 
 
 		 93 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0055  tRNA-Ser  87.8 
 
 		 89 bp  75.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  85.88 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2774  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0064  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000000759704  normal  0.0478316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  87.01 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0007  tRNA-Ser  84.71 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0166763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t084  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0606382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2089  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.835616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  86.42 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0287  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000949487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1765  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.393275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0040  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0022  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t30  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  87.32 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0082  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338045  normal  0.030593 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0040  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.851223  normal  0.588712 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>