299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0005 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  90.43 
 
 		 93 bp  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 93 bp  99.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  93.15 
 
 		 94 bp  97.6  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  88.42 
 
 		 93 bp  87.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 88 bp  83.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 88 bp  83.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  87.23 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  86.32 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0003  tRNA-Ser  86.32 
 
 		 92 bp  73.8  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0650354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  85.11 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0046  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 94 bp  69.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.506638  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  92 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  92 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  92 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  92 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0055  tRNA-Ser  86.84 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  88 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  88 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290353  normal  0.259608 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000899468  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  60  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2302  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0031267  hitchhiker  2.33425e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.163245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0656  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0036  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366814 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0031  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.981637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0032  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0066  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  82.98 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  82.98 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0003  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.323881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>