296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0023 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.137885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 91 bp  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 92 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  89.87 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  88 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  87.34 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  88 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0001  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0037  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  92 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0064  tRNA-Ser  87.34 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000000759704  normal  0.0478316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0040  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.851223  normal  0.588712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t30  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0041  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0082  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338045  normal  0.030593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0054  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000329774  hitchhiker  1.7085e-24 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  86.57 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1096  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0022  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0287  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000949487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  89.39 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t084  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0606382 
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  85.33 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0042  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121503  normal  0.0171671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 92 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0066  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  87.88 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  83.54 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  83.54 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0007  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0166763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0002  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3166t  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.197881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0017  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000565076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0002  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000353165 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2774  tRNA-Ser  88 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>