192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0055 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  98.89 
 
 		 90 bp  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0001  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 93 bp  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0031  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0145328  normal  0.103161 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  86.81 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  92 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  83.72 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  83.72 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0042  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0015  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00859623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0050  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  86.76 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  89.8 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0049  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0020  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000279597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0037  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0024  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.595817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0044  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.990986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0034  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0467968  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  82.22 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0023  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  82.22 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  82.22 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0055  tRNA-Ser  88 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0019  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0003  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  hitchhiker  0.00000112362 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.582085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>