18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0040 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0046  tRNA-Cys  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.262416  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0046  tRNA-Cys  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0014  tRNA-Cys  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000003248  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0022  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000019175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>