30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0005 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02010  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0015  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0037  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0054  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000000361768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>