50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03320 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  180  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  94.51 
 
 
91 bp  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  92.31 
 
 
91 bp  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  88.51 
 
 
90 bp  79.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  86.81 
 
 
90 bp  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  86.42 
 
 
91 bp  73.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  97.56 
 
 
90 bp  73.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  86.42 
 
 
91 bp  73.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03510  tRNA-Ser  95.24 
 
 
86 bp  67.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.608877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0012  tRNA-Ser  89.19 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  54  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 
92 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  89.13 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  89.13 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  89.13 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  87.1 
 
 
90 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  89.13 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  89.13 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  89.13 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  96.55 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  93.94 
 
 
90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  93.94 
 
 
90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  93.94 
 
 
90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  93.94 
 
 
90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0034  tRNA-Ser  91.67 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0467968  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0050  tRNA-Ser  91.67 
 
 
95 bp  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  91.43 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  96.3 
 
 
85 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  91.43 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 
88 bp  44.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  44.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0089  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  44.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  44.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  44.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  91.18 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  93.33 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0040  tRNA-Cys  100 
 
 
77 bp  44.1  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000925969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 
91 bp  44.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  44.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>