30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0054 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  95.6 
 
 		 91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03320  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0011  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0010  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  81.8  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03510  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.608877  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0004  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0048    100 
 
 		 389 bp  44.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0009    100 
 
 		 366 bp  44.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101649  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>