44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_R0007 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  92.77 
 
 		 87 bp  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  91.76 
 
 		 90 bp  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  89.89 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  87.21 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0008  tRNA-Ser  91.53 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  90.32 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  86.89 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  86.89 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6026  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0020  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000391887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>