26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_R0006 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0058  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.479473  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0056  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0005  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0057  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0062  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0006  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 89 bp  69.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0055  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 92 bp  69.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  95 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14044  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0590766  normal  0.664397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0004  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0057  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.861934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0012  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0013  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01650  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851921  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0064  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59858e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>