64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0060 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  96.7 
 
 		 90 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0008  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.497275  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0008  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 87 bp  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  95.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0008  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 85 bp  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0008  tRNA-Ser  89.29 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0059  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0007  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 90 bp  85.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0169683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04530  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303031  normal  0.07409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0008  tRNA-Ser  97.62 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0050  tRNA-Ser  97.56 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.628519  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1364  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0004  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0002  tRNA-Ser  85.9 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26020  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0053  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0008  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  82.42 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0026  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0092  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.2204  hitchhiker  0.0044365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0064  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000000759704  normal  0.0478316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t28  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA35  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189455  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R29  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t084  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0606382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0059  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00759198  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2323  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0049  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000614407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0048  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0040  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.469236  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0060  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0062  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0076  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0083  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0290175  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0086  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0207844  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0086  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0257958  normal  0.0951833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t038  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>